鳄鱼在发情期表现得异常兴奋，公鳄鱼通过低沉的吼声吸引异性，而母鳄鱼则会大方地走向心仪的对象并相互摩擦吻部以示好感。每条公鳄鱼都有自己领地，他们会通过吼声吸引路过的母鳄鱼。交配过程中，公鳄鱼的泄殖腔位于后腿与尾巴连接处的肚子上，既作为排泄和生殖器官，又在交配时将阴茎露出。交配时间虽然短暂，但却非常高效，避免了不必要的麻烦。母鳄鱼在交配结束后立刻进入母性状态，开始筑巢孵化鳄鱼蛋。它们会选择水流缓慢的地方筑巢，并用各种材料构建碗形巢穴。筑巢耗时较长，约需7天。母鳄鱼会将鳄鱼蛋放在巢中并密封洞口，借助巢内的建筑材料腐烂产生的热量来保持适宜的温度。这种独特的孵蛋方式使得母鳄鱼无需像母鸡一样守护鸡蛋。然而，如果气候过于干燥，母鳄鱼会通过拍打水流为巢穴增加湿度，以确保胚胎的正常发育。经过大约80天的孕育，小鳄鱼将破壳而出，母鳄鱼对于产卵时间的把握非常精确，总是能在合适的时间挖掘巢穴，让小鳄鱼顺利诞生。
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